2043 年，臭名昭著的犯罪大王将军落网，即将由铁面无私的法官余铁雄主审。为逃避法律制裁，将军派遣手下健穿越时空回到五十年前，企图在审判前洗脑余铁雄，使其丧失判案能力。政府获悉阴谋后，紧急派出飞龙特警铁面、扫帚头及发达星重返 1993 年，全力保护年轻时的铁雄免受侵害。
三位特警潜入一所中学展开行动，扫帚头化身教师，铁面伪装成学生，发达星则担任跟班。他们的目标是接近长期留班的少年大雄，帮他摆脱同学余忌安的欺凌，并借此套取余铁雄的下落。然而调查陷入僵局，因为大雄坚称校内根本不存在余铁雄这个人，让特警们的任务变得扑朔迷离。
与此同时，反派健也乔装成老师混入校园，伺机对目标下手，而大雄的家庭也正面临变故，其母亲打算改嫁理查德余。在女友采妮的真心陪伴下，大雄不仅要应对校园霸凌，还不知不觉卷入了这场跨越时空的正邪较量。面对内外夹击的危机，飞龙特警能否识破伪装，成功守护未来法官并完成使命，一切悬念都将在这所超级学校中揭晓。
